مطالعه مشاهده‌ای

واریانت‌های بیماری‌زای رده زایا (ژرم‌لاین) در ۱۰٬۳۸۹ سرطان بزرگسالان

Cell · ۲۰۱۸۱۰٬۳۸۹ مورد سرطان از ۳۳ نوع سرطان
Pathogenic Germline Variants in 10,389 Adult CancersHuang Kl, Mashl RJ, Wu Y, Ritter DI, Wang J, Oh C, et al. Cell. 2018. 173:355-370.e14
نوع مطالعه
مطالعه مشاهده‌ای
نام مطالعه
Pan-Cancer Germline
طراحی
تحلیل ژنومی بزرگ‌مقیاس چندسرطانی (pan-cancer) برای شناسایی واریانت‌های مستعدکننده سرطان در رده زایا
حجم نمونه
۱۰٬۳۸۹ مورد سرطان از ۳۳ نوع سرطان
منبع
Cell · ۲۰۱۸

به زبان ساده

در این پژوهش بسیار بزرگ، ژن‌های ۱۰٬۳۸۹ بیمار مبتلا به ۳۳ نوع سرطان بررسی شد و در حدود ۸٪ از آن‌ها تغییرات ژنتیکی ارثی‌ای پیدا شد که احتمال ابتلا به سرطان را بالا می‌برند. پژوهشگران نشان دادند این تغییرات اغلب عملکرد ژن‌های مهار‌کننده سرطان را مختل می‌کنند. نتایج می‌تواند در آینده به تفسیر بهتر آزمایش‌های ژنتیک کمک کند. اگر سابقه خانوادگی سرطان دارید، تصمیم‌گیری درباره آزمایش ژنتیک را با پزشک یا مشاور ژنتیک در میان بگذارید.

نتایج کلیدی

۸۵۳ واریانت در ۸٪ از ۱۰٬۳۸۹ مورد
واریانت‌های بیماری‌زا یا احتمالاً بیماری‌زا
۳۳ نوع سرطان
۲۱ ژن
ژن‌های دارای ارتباط تک‌سرطانی یا بین‌سرطانی
شامل ارتباط‌های جدید SDHA در ملانوم و PALB2 در آدنوکارسینوم معده
۶۵۹ واریانت و ۱۸ حذف بزرگ اضافی
واریانت‌های مستعدکننده در ژن‌های سرکوبگر تومور
شامل ATM، BRCA1 و NF1؛ بیان پایین ژن و از دست رفتن هتروزیگوسیته یا رویداد دوضربه‌ای دوآللی در ۴۳٪
۳۳ واریانت
واریانت‌های مستعدکننده در انکوژن‌ها
شامل میس‌سنس‌های MET، RET و PTPN11 همراه با بیان بالای ژن
۴۷ واریانت
واریانت‌های مستعدکننده اضافی نامزدشده از VUSهای اولویت‌بندی‌شده
بر پایه شواهد چندگانه: فراوانی در مورد-شاهد، LOH، اثر بر بیان و هم‌مکانی با جهش‌ها و باقی‌مانده‌های تغییریافته

جمعیت مطالعه

۱۰٬۳۸۹ مورد سرطان بزرگسالان از ۳۳ نوع سرطان. جزئیات معیارهای ورود در متن کامل مقاله آمده است.

نقاط پایانی

شناسایی واریانت‌های بیماری‌زا یا احتمالاً بیماری‌زای رده زایا و ارتباط آن‌ها با انواع سرطان؛ بررسی پیامدهای عملکردی این واریانت‌ها (بیان ژن، از دست رفتن هتروزیگوسیته و رویدادهای دوضربه‌ای)؛ و معرفی واریانت‌های با اهمیت نامشخص (VUS) دارای شواهد حمایتی چندگانه. جزئیات نقاط پایانی دقیق در چکیده ذکر نشده است.

ایمنی و عوارض

مطالعه مداخله‌ای نبوده و داده ایمنی ندارد.

اهمیت بالینی و جایگاه در رهنمودها

بر پایه چکیده، این مطالعه شواهدی برای ارتباط واریانت‌های نادر رده زایا با پیامدهای عملکردی فراهم می‌کند و می‌تواند راهنمای آینده طبقه‌بندی واریانت‌ها و آزمایش ژنتیک رده زایا در سرطان باشد. چکیده درباره تغییر مستقیم رویه بالینی یا تأیید در رهنمودها اظهارنظر نمی‌کند؛ وضعیت فعلی رهنمودها باید جداگانه بررسی شود.

ترجمه فارسی چکیده مقاله

پیش‌زمینه و روش‌ها

ما بزرگ‌ترین بررسی واریانت‌های مستعدکننده سرطان تا به امروز را انجام دادیم و ۸۵۳ واریانت بیماری‌زا یا احتمالاً بیماری‌زا را در ۸٪ از ۱۰٬۳۸۹ مورد از ۳۳ نوع سرطان یافتیم.

نتایج

بیست‌ویک ژن ارتباط‌های تک‌سرطانی یا بین‌سرطانی نشان دادند، از جمله ارتباط‌های جدید SDHA در ملانوم و PALB2 در آدنوکارسینوم معده. ۶۵۹ واریانت مستعدکننده و ۱۸ حذف بزرگ اضافی در ژن‌های سرکوبگر تومور، از جمله ATM، BRCA1 و NF1، بیان پایین ژن و از دست رفتن هتروزیگوسیته (LOH) یا رویدادهای دوضربه‌ای دوآللی را در موارد مکرر (۴۳٪) نشان دادند. همچنین ۳۳ واریانت از این‌گونه را در انکوژن‌ها یافتیم، از جمله میس‌سنس‌هایی در MET، RET و PTPN11 که با بیان بالای ژن همراه بودند. ما ۴۷ واریانت مستعدکننده اضافی را از میان VUSهای اولویت‌بندی‌شده که با شواهد چندگانه شامل فراوانی مورد-شاهد، LOH، اثر بر بیان و هم‌مکانی با جهش‌ها و باقی‌مانده‌های تغییریافته پشتیبانی می‌شدند، نامزد کردیم.

نتیجه‌گیری

رویکرد یکپارچه ما واریانت‌های مستعدکننده نادر را به پیامدهای عملکردی مرتبط می‌کند و می‌تواند راهنمای آینده طبقه‌بندی واریانت‌ها و آزمایش ژنتیک رده زایا در سرطان باشد.

محدودیت‌ها

چکیده محدودیت‌ها را شرح نمی‌دهد و جزئیات آن‌ها در متن کامل مقاله است. واریانت‌های با اهمیت نامشخص (VUS) نامزدشده در این مطالعه «نامزد» هستند و پیش از کاربرد بالینی نیاز به شواهد تکمیلی دارند.

این خلاصه و ترجمه بر اساس چکیده منتشرشده مقاله (PubMed) تهیه شده است؛ برای جزئیات کامل، به‌ویژه دوزها و نتایج فرعی، به متن کامل مقاله مراجعه کنید.